ไมโครไบโอม (microbiome) เป็นองค์ความรู้หนึ่งที่กำลังได้รับความสนใจในงานวิชาการและในวงการอุตสาหกรรม เป็นการศึกษาวิธีการจัดการและเข้าใจพฤติกรรมของประชากรจุลินทรีย์เพื่อป้องกันความเสี่ยงจากจุลินทรีย์ก่อโรค และเพื่อเพิ่มความสามารถในการรักษาสุขภาพร่างกายให้แข็งแรง พร้อมทั้งมีวิธีการรักษาโรคที่เหมาะสม การบูรณาการข้อมูลไมโครไบโอมใน 3 มิติของห่วงโซ่อาหาร (microbiome in three dimensions of food chain) ได้แก่ ไมโครไบโอมในพืชและสิ่งแวดล้อม ไมโครไบโอมในสัตว์ และไมโครไบโอมในอาหาร จะมีบทบาทเพิ่มมากขึ้นในการเฝ้าระวังการปนเปื้อนของกลุ่มประชากรจุลินทรีย์รอบตัวเราที่ได้รับการถ่ายทอดจากพืช สิ่งแวดล้อม และสัตว์ ซึ่งอาจจะเกี่ยวข้องกับต้นกำเนิดและวิวัฒนาการของเชื้อโรค
อีกทั้งความก้าวหน้าของการใช้เทคนิค metagenomics ที่ใช้สำรวจไมโครไบโอมตลอดห่วงโซ่อาหารจะนำไปสู่ยุคใหม่แห่งการเฝ้าระวังความปลอดภัยด้านอาหาร (new era in food safety surveillance) และยุคใหม่แห่งการเฝ้าระวังทางสาธารณสุข (new era in public health surveillance) หลังจากการระบาดของโรคโควิด 19 เพื่อสร้างองค์ความรู้ด้านการวิจัยเกี่ยวกับความสัมพันธ์ของอาหารปลอดภัยต่อไมโครไบโอมของมนุษย์ และการเฝ้าระวังโรคติดต่อจากสัตว์สู่มนุษย์ในงานด้านสาธารณสุข เพื่อเตรียมรับมือกับโรคอุบัติใหม่ที่อาจจะเกิดขึ้นในอนาคต