สงครามนี้เกิดขึ้นจากความขัดแย้งทางด้านเชื้อชาติภายในบอสเนียฯ โดยเป็นการต่อสู้กันระหว่าง ชาวบอสเนียที่นับถือศาสนาอิสลาม หรือชาวบอสนีแอก (Bosniaks) , ชาวบอสเนียที่มีเชื้อสายโครแอต (Croat : ได้รับการสนับสนุนจากโครเอเชีย) และชาวบอสเนียที่มีเชื้อสายเซิร์บ (Serb : ได้รับการสนับสนุนจากเซอร์เบีย)