แต่ด้วยอุณหภูมิเฉลี่ยของโลกที่เพิ่มขึ้นเรื่อยๆ นักวิทยาศาสตร์จึงเป็นกังวลว่าต้นไม้อาจจะหยุดดูดซับและกักเก็บ CO2 และอาจจะเกิดเหตุการณ์กลับกัน นั่นคือคาร์บอนที่ต้นไม้กักเก็บไว้จะถูกปลดปล่อยกลับคืนสู่บรรยากาศโลก เร่งให้โลกร้อนยิ่งขึ้นกว่าเดิม
ต้นไม้ปลดปล่อยคาร์บอนกลับคืนสู่บรรยากาศโลกได้หลายทาง ต้นไม้จะต้องหายใจเหมือนสิ่งมีชีวิตอื่นๆ เพื่อเปลี่ยนโมเลกุลน้ำตาลให้เป็นพลังงาน และการหายใจของต้นไม้ก็จะปลดปล่อยก๊าซ CO2 ออกสู่บรรยากาศโลก นอกจากนี้ หากต้นไม้ตายแล้ว พวกมันก็อาจจะถูกย่อยสลายโดยจุลชีพหรือถูกเผาไม้จากไฟป่าซึ่งส่งผลให้เกิดการปลดปล่อยก๊าซ CO2 ออกสู่บรรยากาศโลกได้เช่นกัน ในปัจจุบันต้นไม้มีอัตราการดูดซับ CO2 สูงกว่าอัตราการปลดปล่อย CO2 ทำให้ต้นไม้ยังสามารถกักเก็บคาร์บอนเอาไว้ได้