นายกรัฐมนตรีสิงคโปร์คนที่สอง โก๊ะ จ๊กตง แต่งตั้งเขาเป็นรัฐมนตรีอาวุโสในปี ค.ศ. 1990(พ.ศ. 2533) เขาดำรงตำแหน่งที่ปรึกษารัฐมนตรีที่ปรึกษา ตั้งโดยบุตรของเขา ลี เซียนลุง เมื่อลี เซียนลุงเป็นนายกรัฐมนตรีคนที่สามของประเทศในเดือนสิงหาคม ค.ศ. 2004(พ.ศ. 2547)
ด้วยตำแหน่งรัฐมนตรีติดต่อกันเป็นเวลากว่า 50 ปีของเขา ลียังเป็นรัฐมนตรีที่รับราชการนานที่สุดในประวัติศาสตร์คนหนึ่ง จนกระทั่งเมื่อวันที่ 14 พฤษภาคม ค.ศ. 2011(พ.ศ. 2554) ลีและโก๊ะตัดสินใจประกาศเกษียณจากคณะรัฐมนตรีหลังการเลือกตั้งทั่วไป แต่ลียังเป็นสมาชิกรัฐสภาเหมือนเดิม