นับแต่นั้นมาเขาก็แบ่งเวลาใช้ชีวิตระหว่างบ้านในฮาวายและญี่ปุ่น โดยรักษาตารางชีวิตที่เคร่งครัดมากเพื่อให้เอื้อต่อการเขียนงานของเขาเสมอมา นั่นคือตื่นนอนตอนตี 4 เพื่อเขียนหนังสือ 5 ถึง 6 ชั่วโมง ก่อนจะไปว่ายน้ำและวิ่งในระยะทางไกล แล้วเข้านอนตอน 3 ทุ่ม ในปี 1996 มูราคามิสามารถวิ่งอัลตรามาราธอนครั้งแรกสำเร็จที่เกาะฮอกไกโด ประเทศญี่ปุ่น และเขาได้เขียนบรรยายถึงความสำคัญของการวิ่งที่มีต่อตัวเขาไว้ในบันทึกความทรงจำเรื่อง เกลียดเม็ดถั่วและเรื่องอื่นๆ หรือ What I Talk About When I Talk About Running (2007)