ถึงแม้ว่าจะไม่ได้มีหลัฏฐานชัดเจน แต่ถึงอย่างนั้นคนในปัจจุบันก็ยังคงถกเถียงกันถึงตัวตนของพระสันตะปาปาโยนอยู่ดี ตลอดจนมองว่ามันมีความเป็นไปได้อยู่บ้าง เช่นใน THE FEMALE POPE: THE MYSTERY OF POPE JOAN มีทฤษฎีว่าถ้าพระสันตะปาปาโยนมีตัวตนจริงก็น่าจะมีอยู่ในระหว่างช่วงปี 1086 - 1108 ซึ่งมันจะไปสอดคล้องกับในพงศาวดารเมืองแม็สทันที ซึ่งระบุว่าเกิดขึ้นในปี 1099 รวมไปยังยังคงคนที่เชื่อว่าเรื่องราวของพระสันตะปาปาโยนนั้นมีจริง แต่อาจจะไม่ได้เหมือนกับในตำนานก็มีเหมือนกัน
Rustici, Craig M. The Afterlife of Pope Joan: Deploying the Popess Legend in Early Modern England. University of Michigan Press, 2006. https://doi.org/10.3998/mpub.135037.